《生化危机6》的故事发生在2013年，舞台为美国、中国和东欧，主角为里昂、克里斯和另一迷之角色。美国总统决定向公众公布“浣熊市惨剧”的真相，可就在这时，另一场“生化危机”爆发了，里昂不得不亲自手刃已经变异的总统。而在中国方面，克里斯率领着BSAA小队也陷入了困境。东欧则是各种B.O.W武器被大面积使用，迷之角色在那里举步维艰。
